I Nature Genetics presenteras en studie i vilken man identifierat 48 gener som kan kopplas till multipel skleros och som tidigare varit okända i detta sammanhang. Multicenterstudien omfattar 84 forskargrupper från 13 länder, däribland Sverige. Bland annat har forskare från Karolinska institutet ingått.
I ett första steg har författarna gjort en genetisk analys, en så kallad helgenomundersökning (GWAS), vilket innebär att man letat mycket brett i hela genomet. 14 498 patienter med MS har ingått. Patienterna har jämförts med 24 091 friska kontroller.
Ett antal intressanta kandidatområden i genomet har identifierats. Dessa har sedan analyserats i ännu en kohort med ytterligare 14 802 MS-patienter och 26 703 kontroller. Samtliga deltagare i båda kohorter är av europeiskt ursprung.
Ur de båda kohorterna har 48 nyupptäckta »MS-gener« identifierats, vilket innebär att antalet kända gener som kan kopplas till MS nästan fördubblats. Gener som sedan tidigare redan kopplats till sjukdomen kunde för övrigt verifieras i den aktuella studien. Tillsammans svarar de nyupptäckta generna för i storleksordningen 20 procent av den totala genetiska risken för MS. Enskilda gener, det vill säga varje gen var för sig, spelar bara en blygsam roll i den totala risken för sjukdomen.
Intressant i sammanhanget är att många av de identifierade generna tidigare visats spela en roll i andra autoimmuna sjukdomar vid sidan av MS.
Studien är den hittills största i sitt slag. I storleksordningen 2,5 miljoner människor världen över lider av MS. Patogenesen är ofullständigt känd men att ärftlighet spelar in är klarlagt.
Referenser
International Multiple Sclerosis Genetics Consortium (MSGC); Beecham AM, et al. Nat Genet. Epub sep 2013. doi: 10.1038/ng.2770
Pressmeddelandet: http://news.ncsu.edu/releases/wms-beisel-crispr2014/
Publicerad artikel: http://mbio.asm.org/content/5/1/e00928-13
Hemsidan för CRISP: http://www.crispr-cas.org/
Abstract: CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas (CRISPR-associated) systems in bacteria and archaea employ CRISPR RNAs to specifically recognize the complementary DNA of foreign invaders, leading to sequence-specific cleavage or degradation of the target DNA. Recent work has shown that the accidental or intentional targeting of the bacterial genome is cytotoxic and can lead to cell death. Here, we demonstrate that genome targeting with CRISPR-Cas systems can be employed for the sequence-specific and titratable removal of individual bacterial strains and species. Using the type I-E CRISPR-Cas system in Escherichia coli as a model, we found that this effect could be elicited using native or imported systems and was similarly potent regardless of the genomic location, strand, or transcriptional activity of the target sequence. Furthermore, the specificity of targeting with CRISPR RNAs could readily distinguish between even highly similar strains in pure or mixed cultures. Finally, varying the collection of delivered CRISPR RNAs could quantitatively control the relative number of individual strains within a mixed culture. Critically, the observed selectivity and programmability of bacterial removal would be virtually impossible with traditional antibiotics, bacteriophages, selectable markers, or tailored growth conditions. Once delivery challenges are addressed, we envision that this approach could offer a novel means to quantitatively control the composition of environmental and industrial microbial consortia and may open new avenues for the development of “smart” antibiotics that circumvent multidrug resistance and differentiate between pathogenic and beneficial microorganisms.
Forskningen om crisp tog fart för att minska förlusterna i produktionen av yoghurt. Mejeribranschen har nämligen problem med virus som infekterar de bakterier som skapar yoghurt.
Forskningen bygger på att lura det så kallade Crispr-cas-systemet, vilket är bakteriens immunförsvar mot skadlig dna. Vad forskarna gjort är att med hjälp av syntetisk biologi koda om immunförsvaret så att bakterien istället klipper sönder sitt eget dna på ett sätt som också dödar den.
Ett stort problem med dagens antibiotika är att de ofta dödar bakterier som inte orsakar sjukdomen man vill bota. Det leder till att utvecklingen av antibiotikarestistens ökar och att redan resistenta bakterier lättare förökar sig. Att bakterier dör när Crispr-systemet riktas mot deras egna dna är känt sedan tidigare. Den nya forskningen visar att det är möjligt att väldigt specifikt kan slå ut vissa bakterier med syntetiskt programmerade dnasekvenser.
-Vi har kunnat döda Salmonella i en bakteriekultur utan att påverka goda bakterier som normalt finns i tarmarna, säger Chase Biesel, assisterande professor i chemical and biomolecular engineering, vid North Carolina state university.
Förutom att slå ut enskilda arter av en bakterie har forskarna även visat att den nya tekniken kan döda specifika stammar av bakterier av samma art. I en blandning av två bakterier av samma art, dödades endast den ena, trots att bakterierna till 99 procent hade samma dna.
-Genom att rikta Crispr-cas-systemet mot specifika dnasekvenser kunde vi undvika mekanismerna bakom de många exemplen av antibiotikaresistens som finns i dag, säger Chase Biesel.
De amerikanska forskarna försöker nu hitta effektiv metod att föra in sina syntetiska Crispr-system hos en sjuk person.
Systemet bygger på att avlägsna bakteriernas förmåga att skydda sig mot antibiotika genom att klippa sönder deras resistensgener. Om en person inte utsätts för en antibiotikakur finns inget selektionstryck för bakterierna att bli resistenta mot vår behandling.
CRISP Hemsida: http://www.crispr-cas.org/
Välkommen till CRISPR-Cas.org webbsida. Denna webbplats underhålls av Joung Lab vid Massachusetts General Hospital och kommer att ge information och länkar till resurser för dem som är intresserade av att använda inriktningsbar CRISPR / Cas-system för genomteknik och andra applikationer. CRISPR / Cas system används av olika bakterier och arkéer till medla försvar mot virus och andra främmande nukleinsyra. Färskt arbete har visat att typ II CRISPR / CAS-system kan vara konstruerad för att direkt riktad dubbelsträngade DNA-avbrott in vitro till specifika sekvenser genom användning av en enda "guide-RNA" med komplementaritet till målstället DNA och en Cas9 nukleas (Jinek et al ., Science 2012). Denna inriktningsbar Cas9 baserade systemet fungerar även effektivt i odlade humanceller (Mali et al. Science 2013,. Cong et al, Science 2013) och in vivo i zebrafisk (Hwang och Fu et al. under tryckning för att inducera målinriktade ändringar) in i endogena gener. Vi hoppas att den information som finns på denna webbsida kommer att vara till hjälp för dem som är intresserade av att använda CRISPR / Cas-system för genomteknik. Observera att denna hemsida är under uppbyggnad och ytterligare uppdateringar kommer att finnas inom en snar framtid. Vi välkomnar även förslag på ytterligare material om CRISPR / Cas-tekniken ännu inte är noterade på dessa sidor.
En ny lovande teknik för genetisk terapi av olika sjukdomar anser jag.
SVT informerar
http://www.svt.se/nyheter/vetenskap/skraddarsydd-dna-arets-stora-genombrott
Göran Svensson
Specialist i allmänmedicin
Pensionerad
